MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 3743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004842	AGGA	2	8	1120639	1120646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_004842	ATCA	2	8	1120679	1120686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_004842	TAT	2	6	1120698	1120703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_004842	CGC	2	6	1120737	1120742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_004842	CAT	2	6	1120753	1120758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_004842	GCA	2	6	1120761	1120766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_004842	TGC	2	6	1120853	1120858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_004842	GCCA	2	8	1121392	1121399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_004842	ATT	2	6	1125310	1125315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_004842	CTT	2	6	1127258	1127263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_004842	TGG	2	6	1127856	1127861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_004842	GC	3	6	1127931	1127936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_004842	TAC	2	6	1127957	1127962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_004842	TACC	2	8	1128008	1128015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_004842	TCA	2	6	1128083	1128088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_004842	CGC	2	6	1128098	1128103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_004842	AC	3	6	1128138	1128143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_004842	GAAAG	2	10	1128184	1128193	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_004842	CTC	2	6	1129400	1129405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_004842	AC	3	6	1129426	1129431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_004842	AGC	2	6	1129465	1129470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_004842	AAC	2	6	1132268	1132273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_004842	GAC	2	6	1132296	1132301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_004842	GCT	2	6	1132308	1132313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_004842	A	6	6	1132383	1132388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_004842	T	6	6	1132399	1132404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_004842	GTT	2	6	1133816	1133821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_004842	GAA	3	9	1137819	1137827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_004842	GAT	2	6	1137836	1137841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_004842	A	6	6	1137909	1137914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_004842	AGC	3	9	1137965	1137973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_004842	AGG	2	6	1139846	1139851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_004842	TGGGA	2	10	1139859	1139868	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_004842	CAT	2	6	1139954	1139959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_004842	AAAT	2	8	1140030	1140037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_004842	ATC	3	9	1140062	1140070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_004842	TA	3	6	1143066	1143071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_004842	T	6	6	1143092	1143097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_004842	TAA	2	6	1143104	1143109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_004842	A	6	6	1146252	1146257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_004842	TAG	2	6	1147085	1147090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_004842	ATT	2	6	1147135	1147140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_004842	ATT	2	6	1147957	1147962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_004842	CAA	2	6	1148009	1148014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_004842	AGGT	2	8	1148075	1148082	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_004842	GCCT	2	8	1148091	1148098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_004842	TC	3	6	1148125	1148130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_004842	ATAA	2	8	1148183	1148190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_004842	TA	4	8	1148198	1148205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_004842	TTTA	2	8	1148213	1148220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_004842	TG	3	6	1148232	1148237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_004842	AT	3	6	1148350	1148355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_004842	AC	3	6	1148481	1148486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_004842	TA	3	6	1148557	1148562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_004842	TAT	2	6	1151201	1151206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_004842	AAG	2	6	1153018	1153023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_004842	TGT	2	6	1153438	1153443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_004842	GTT	2	6	1153483	1153488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_004842	TCG	2	6	1153508	1153513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_004842	CGG	2	6	1154839	1154844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_004842	CAA	2	6	1154892	1154897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_004842	TGAG	2	8	1154921	1154928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_004842	TAA	2	6	1158446	1158451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_004842	ACTAG	2	10	1161355	1161364	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3565	NC_004842	TACCC	2	10	1161374	1161383	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3566	NC_004842	GAT	2	6	1161384	1161389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_004842	ATA	2	6	1161398	1161403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_004842	TTTA	2	8	1161426	1161433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_004842	CCA	2	6	1162639	1162644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_004842	TGTC	2	8	1162687	1162694	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_004842	GC	3	6	1164437	1164442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_004842	CGC	2	6	1164446	1164451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_004842	GATA	2	8	1166073	1166080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_004842	AGC	2	6	1166131	1166136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_004842	CGC	2	6	1166137	1166142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_004842	AAT	2	6	1166670	1166675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_004842	CA	3	6	1166712	1166717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_004842	TG	3	6	1166737	1166742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_004842	AG	3	6	1166857	1166862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_004842	ATG	2	6	1166925	1166930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_004842	CTTGT	2	10	1166958	1166967	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3582	NC_004842	GT	3	6	1166977	1166982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_004842	CGTG	2	8	1167007	1167014	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_004842	GGC	2	6	1167023	1167028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_004842	TGC	2	6	1168271	1168276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_004842	AGT	2	6	1168278	1168283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_004842	ATT	2	6	1170241	1170246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_004842	TG	3	6	1170250	1170255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_004842	TGA	2	6	1170271	1170276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_004842	GT	3	6	1170401	1170406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_004842	CGG	2	6	1172665	1172670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_004842	CAC	2	6	1172680	1172685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_004842	AG	3	6	1172686	1172691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_004842	TACTTT	2	12	1175403	1175414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3595	NC_004842	CGC	2	6	1175479	1175484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_004842	GC	3	6	1176566	1176571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_004842	GC	3	6	1176573	1176578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_004842	GGCG	2	8	1176617	1176624	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_004842	AT	3	6	1176642	1176647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_004842	TGT	3	9	1176664	1176672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_004842	CGG	2	6	1176685	1176690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_004842	ACC	2	6	1178130	1178135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_004842	TG	3	6	1178203	1178208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_004842	CTC	2	6	1179489	1179494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_004842	ATG	2	6	1179816	1179821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_004842	ATC	2	6	1179878	1179883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_004842	AGT	2	6	1179896	1179901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_004842	TAG	2	6	1179904	1179909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_004842	TAG	2	6	1179916	1179921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_004842	CAG	2	6	1179925	1179930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_004842	GGA	2	6	1179940	1179945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_004842	CAAC	2	8	1179990	1179997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_004842	CCT	2	6	1180013	1180018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_004842	TGA	2	6	1180066	1180071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_004842	GTG	2	6	1180147	1180152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_004842	TACC	2	8	1180200	1180207	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_004842	GCACCA	2	12	1180212	1180223	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_004842	ACC	2	6	1180354	1180359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_004842	TGT	2	6	1180363	1180368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_004842	CAC	2	6	1180393	1180398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_004842	TAC	2	6	1180422	1180427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_004842	ACA	2	6	1180459	1180464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_004842	AG	3	6	1180500	1180505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_004842	AAG	2	6	1180563	1180568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_004842	TTA	2	6	1180596	1180601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_004842	AAG	2	6	1180686	1180691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_004842	CTA	2	6	1180714	1180719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_004842	TG	3	6	1180742	1180747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_004842	GCA	2	6	1180768	1180773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_004842	CAA	2	6	1180778	1180783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_004842	CCA	3	9	1180807	1180815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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